Budynek ten był częścią średniowiecznych fortyfikacji, które niegdyś otaczały Greifswald.
Fangenturm została po raz pierwszy wymieniona w rejestrze miejskim w 1329 r. jako "Vangentorm". Wieża o wysokości 13,50 m pozostała rudymentem po zniwelowaniu terenów w obszarze Schützenwall w XVIII wieku i zbudowaniu Hansering w latach 70-tych XX wieku. Później, gdy budynek nie spełniał już wymagań jako wieża prochowa, miasto wydzierżawiło go uniwersytetowi w 1775 roku, który przez pewien czas wykorzystywał wieżę jako obserwatorium ze względu na jej wysokość i położenie na obrzeżach miasta. Mury obronne zostały dodane dopiero w połowie XIX wieku, kiedy to Fangenturm była nawet używana jako publiczna toaleta. Po szeroko zakrojonych pracach konserwatorskich i renowacyjnych w latach 90-tych, kapitan portu muzealnego mógł przenieść się do swojego biura na parterze. Ponosi on odpowiedzialność organizacyjną za port z ponad 50 miejscami do cumowania, które są zarezerwowane wyłącznie dla zdatnych do żeglugi tradycyjnych statków.
