Dit gebouw maakte deel uit van de middeleeuwse vestingwerken die Greifswald ooit omringden.
De Fangenturm werd voor het eerst vermeld in het stadsregister in 1329 als "Vangentorm". 13,50 meter hoog bleef de toren als rudiment staan nadat het terrein in het gebied van de Schützenwall in de 18e eeuw werd geëgaliseerd en de Hansering in de jaren 1970 werd gebouwd. Later, toen het gebouw niet meer voldeed als kruittoren, verhuurde de stad het in 1775 aan de universiteit, die de toren vanwege zijn hoogte en ligging aan de rand van de stad een tijdje als observatorium gebruikte. De kantelen werden pas in het midden van de 19e eeuw toegevoegd, toen de Fangenturm zelfs als openbaar toilet werd gebruikt. Na uitgebreide conserverings- en renovatiewerkzaamheden in de jaren 1990 kon de havenmeester van de museumhaven zijn kantoor op de begane grond betrekken. Hij is organisatorisch verantwoordelijk voor de haven met meer dan 50 ligplaatsen, die uitsluitend zijn gereserveerd voor zeewaardige traditionele schepen.