In de directe omgeving van de vuurtorens steken tientallen ventilatiepijpen uit de grond. De geschiedenis van de bunkers op Kaap Arkona is lang. Het begint in 1915 met de bouw van de eerste bunker, die niet is gerenoveerd en om veiligheidsredenen niet toegankelijk is voor het publiek.
De kleinere bunker is afkomstig van de Wehrmacht en werd in de DDR-tijd omgebouwd tot het kantoor van de 6e Kustgrensbrigade. Hij staat bekend als de "Arkona bunker". Tegenwoordig herbergt het documentatie over de geschiedenis van Kaap Arkona, van de Slavische tijd tot nu. De toegang is gratis. De grotere bunker werd gebouwd tussen 1979 en 1986. Vanuit een centrale hoofdgang met twee ingangen zijn er verschillende onafhankelijke individuele bunkers met een totale oppervlakte van 2.000 vierkante meter. Het diende als commandopost voor het 6e Flottielje van de Volksvloot en de Verenigde Baltische Vloot (VOF) gestationeerd op de boeg. De bunkers dienden als een zogenaamde "beschermde commandopost" en waren bedoeld als bescherming tegen giftige gassen en radioactieve straling in geval van oorlog. De tweede grote buis herbergt nu een modelscheepstentoonstelling en oude navigatieapparatuur. De faciliteit werd buiten gebruik gesteld op de dag van de Duitse hereniging, 3 oktober 1990.
