De gebouwen van de voormalige joodse gemeente Hagenow maken sinds 2001 deel uit van het museum. Het ensemble rond de synagoge, gebouwd in de Hagenstraße in 1828, is uniek in Mecklenburg.
Het voorste gebouw huisvestte de religieuze school met de leraren- en conciërgewoningen en het rituele bad (mikvah). De imposante synagoge en de koetsenstalling staan op de binnenplaats. Hoewel het interieur van de synagoge werd verwoest in de pogromnacht van 1938, bleef de inhoud van de gebouwen behouden en werden ze tussen 2004 en 2009 uitgebreid gerestaureerd. De permanente tentoonstelling "Sporen van joods leven in Hagenow en West-Mecklenburg" is sinds 2010 te zien in het voorgebouw, nu het Hanna Meinungenhuis. Naast drie speciale tentoonstellingen van kunst en fotografie vinden er in de Oude Synagoge regelmatig concerten, lezingen en culturele evenementen plaats.