De haven van Bodstedt ligt aan de zuidelijke oever van Bodstedter Bodden en is de thuishaven van veel Zeesen boten.
Er zijn verschillende ligplaatsen voor gasten beschikbaar in de smalle havenkom. In de zomermaanden zijn er verschillende bootverbindingen naar Born en Ahrenshoop-Althagen. Er worden ook Zeesenboottochten aangeboden. De Bodstedt Zeesenboot Regatta vindt traditioneel plaats in het eerste weekend van september.